Eine bundesweite Dachorganisation der Mitarbeitervertretungen bei der JUH gibt es seit 1983. Die durch die Mitarbeitervertretungen einzelner Landesverbände gewählten sogenannten Landesmitarbeitervertreter bildeten 1983 eine Bundesmitarbeitervertretung (BMV).

Mit der Reform der damals für die JUH gültigen Mitarbeitervertretungsordnung des Diakonischen Werkes des Evangelischen Kirche Deutschland (EKD) wurde ab 1989 die Bildung einer Gesamtmitarbeitervertretung bei Rechtsträgern mit mehreren Mitarbeitervertretungen verpflichtend geregelt. Dem folgte die JUH, indem sich die Gesamtmitarbeitervertretung der JUH (GMAV) am 12.09.1989 in Münster/Westfahlen konstituierte. Seit dem 01.01.1994 findet das Mitarbeitervertretungsgesetz des Evangelischen Kirche in Deutschland (MVG.EKD) Anwendung.

Die Organisation der GMAV hat sich seitdem stetig weiterentwickelt. Derzeit sind 105 örtliche Mitarbeitervertretungen in der GMAV repräsentiert. Die GMAV der JUH stellt ein Gremium mit mannigfaltigen Aufgaben und weitreichenden Wirkungsbereichen dar.